Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms