Protein–RNA interactions for Protein: Q9C093

SPEF2, Sperm flagellar protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEF2Q9C093 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPEF2Q9C093 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPEF2Q9C093 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPEF2Q9C093 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPEF2Q9C093 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPEF2Q9C093 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPEF2Q9C093 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPEF2Q9C093 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPEF2Q9C093 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPEF2Q9C093 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SPEF2Q9C093 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms