Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms