Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NSD3Q9BZ95 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NSD3Q9BZ95 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NSD3Q9BZ95 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSD3Q9BZ95 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSD3Q9BZ95 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSD3Q9BZ95 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSD3Q9BZ95 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NSD3Q9BZ95 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSD3Q9BZ95 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSD3Q9BZ95 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSD3Q9BZ95 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSD3Q9BZ95 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSD3Q9BZ95 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSD3Q9BZ95 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSD3Q9BZ95 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSD3Q9BZ95 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSD3Q9BZ95 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSD3Q9BZ95 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSD3Q9BZ95 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSD3Q9BZ95 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSD3Q9BZ95 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSD3Q9BZ95 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSD3Q9BZ95 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSD3Q9BZ95 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSD3Q9BZ95 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSD3Q9BZ95 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSD3Q9BZ95 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSD3Q9BZ95 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NSD3Q9BZ95 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSD3Q9BZ95 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSD3Q9BZ95 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NSD3Q9BZ95 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NSD3Q9BZ95 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSD3Q9BZ95 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSD3Q9BZ95 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSD3Q9BZ95 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSD3Q9BZ95 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSD3Q9BZ95 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSD3Q9BZ95 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSD3Q9BZ95 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NSD3Q9BZ95 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NSD3Q9BZ95 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NSD3Q9BZ95 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NSD3Q9BZ95 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NSD3Q9BZ95 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NSD3Q9BZ95 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NSD3Q9BZ95 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NSD3Q9BZ95 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NSD3Q9BZ95 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NSD3Q9BZ95 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NSD3Q9BZ95 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NSD3Q9BZ95 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NSD3Q9BZ95 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NSD3Q9BZ95 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NSD3Q9BZ95 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NSD3Q9BZ95 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NSD3Q9BZ95 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NSD3Q9BZ95 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NSD3Q9BZ95 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NSD3Q9BZ95 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NSD3Q9BZ95 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NSD3Q9BZ95 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NSD3Q9BZ95 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NSD3Q9BZ95 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NSD3Q9BZ95 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NSD3Q9BZ95 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NSD3Q9BZ95 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NSD3Q9BZ95 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NSD3Q9BZ95 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NSD3Q9BZ95 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NSD3Q9BZ95 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NSD3Q9BZ95 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NSD3Q9BZ95 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NSD3Q9BZ95 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NSD3Q9BZ95 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NSD3Q9BZ95 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NSD3Q9BZ95 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NSD3Q9BZ95 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NSD3Q9BZ95 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NSD3Q9BZ95 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NSD3Q9BZ95 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NSD3Q9BZ95 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NSD3Q9BZ95 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NSD3Q9BZ95 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NSD3Q9BZ95 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NSD3Q9BZ95 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NSD3Q9BZ95 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NSD3Q9BZ95 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NSD3Q9BZ95 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NSD3Q9BZ95 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NSD3Q9BZ95 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NSD3Q9BZ95 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NSD3Q9BZ95 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NSD3Q9BZ95 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NSD3Q9BZ95 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NSD3Q9BZ95 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NSD3Q9BZ95 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NSD3Q9BZ95 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NSD3Q9BZ95 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms