Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY67

CADM1, Cell adhesion molecule 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM1Q9BY67 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CADM1Q9BY67 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms