Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTDSS2Q9BVG9 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTDSS2Q9BVG9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTDSS2Q9BVG9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTDSS2Q9BVG9 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTDSS2Q9BVG9 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTDSS2Q9BVG9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTDSS2Q9BVG9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTDSS2Q9BVG9 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTDSS2Q9BVG9 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTDSS2Q9BVG9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTDSS2Q9BVG9 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTDSS2Q9BVG9 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTDSS2Q9BVG9 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTDSS2Q9BVG9 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTDSS2Q9BVG9 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTDSS2Q9BVG9 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS2Q9BVG9 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS2Q9BVG9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS2Q9BVG9 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS2Q9BVG9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS2Q9BVG9 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS2Q9BVG9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS2Q9BVG9 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS2Q9BVG9 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS2Q9BVG9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS2Q9BVG9 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS2Q9BVG9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS2Q9BVG9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS2Q9BVG9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS2Q9BVG9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS2Q9BVG9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS2Q9BVG9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS2Q9BVG9 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS2Q9BVG9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS2Q9BVG9 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS2Q9BVG9 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS2Q9BVG9 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS2Q9BVG9 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS2Q9BVG9 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS2Q9BVG9 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS2Q9BVG9 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS2Q9BVG9 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS2Q9BVG9 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS2Q9BVG9 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS2Q9BVG9 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS2Q9BVG9 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS2Q9BVG9 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS2Q9BVG9 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS2Q9BVG9 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS2Q9BVG9 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS2Q9BVG9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms