Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT88

SYT11, Synaptotagmin-11, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT11Q9BT88 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYT11Q9BT88 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms