Protein–RNA interactions for Protein: Q99471

PFDN5, Prefoldin subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5Q99471 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN5Q99471 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN5Q99471 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN5Q99471 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN5Q99471 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN5Q99471 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN5Q99471 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN5Q99471 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN5Q99471 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN5Q99471 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN5Q99471 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN5Q99471 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN5Q99471 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN5Q99471 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN5Q99471 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN5Q99471 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN5Q99471 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN5Q99471 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN5Q99471 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN5Q99471 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN5Q99471 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN5Q99471 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN5Q99471 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN5Q99471 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN5Q99471 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN5Q99471 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN5Q99471 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN5Q99471 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN5Q99471 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN5Q99471 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN5Q99471 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN5Q99471 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN5Q99471 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN5Q99471 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN5Q99471 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN5Q99471 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN5Q99471 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN5Q99471 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN5Q99471 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN5Q99471 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN5Q99471 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN5Q99471 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN5Q99471 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN5Q99471 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN5Q99471 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN5Q99471 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN5Q99471 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN5Q99471 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN5Q99471 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN5Q99471 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN5Q99471 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN5Q99471 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN5Q99471 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN5Q99471 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN5Q99471 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN5Q99471 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN5Q99471 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN5Q99471 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN5Q99471 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN5Q99471 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN5Q99471 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN5Q99471 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN5Q99471 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN5Q99471 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN5Q99471 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN5Q99471 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN5Q99471 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN5Q99471 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN5Q99471 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN5Q99471 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN5Q99471 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN5Q99471 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN5Q99471 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN5Q99471 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN5Q99471 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN5Q99471 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN5Q99471 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN5Q99471 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN5Q99471 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN5Q99471 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN5Q99471 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN5Q99471 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN5Q99471 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN5Q99471 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN5Q99471 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN5Q99471 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN5Q99471 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN5Q99471 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN5Q99471 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN5Q99471 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN5Q99471 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN5Q99471 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN5Q99471 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN5Q99471 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN5Q99471 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN5Q99471 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN5Q99471 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN5Q99471 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN5Q99471 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN5Q99471 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms