Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MYCBPQ99417 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MYCBPQ99417 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms