Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms