Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms