Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms