Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CMTM3Q96MX0 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CMTM3Q96MX0 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CMTM3Q96MX0 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CMTM3Q96MX0 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CMTM3Q96MX0 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CMTM3Q96MX0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CMTM3Q96MX0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CMTM3Q96MX0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CMTM3Q96MX0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CMTM3Q96MX0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CMTM3Q96MX0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CMTM3Q96MX0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CMTM3Q96MX0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CMTM3Q96MX0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CMTM3Q96MX0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms