Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms