Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms