Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HIC2Q96JB3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms