Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms