Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms