Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms