Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms