Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF0

SRSF12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF12Q8WXF0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF12Q8WXF0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms