Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms