Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHG7

SVIP, Small VCP/p97-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVIPQ8NHG7 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 PTGER4P2-CDK2AP2P2-201ENST00000619442 3123 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 MAN1C1-202ENST00000374329 2461 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 TECTB-201ENST00000369422 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 LINC02133-202ENST00000569726 2626 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 RAB43-205ENST00000393308 4193 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 CXorf21-201ENST00000378962 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 OR10G3-202ENST00000641040 2533 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SVIPQ8NHG7 POLL-201ENST00000299206 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms