Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms