Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Q1

FAM71E2, Protein FAM71E2, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71E2Q8N5Q1 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM71E2Q8N5Q1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM71E2Q8N5Q1 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM71E2Q8N5Q1 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM71E2Q8N5Q1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM71E2Q8N5Q1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM71E2Q8N5Q1 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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FAM71E2Q8N5Q1 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM71E2Q8N5Q1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM71E2Q8N5Q1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM71E2Q8N5Q1 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM71E2Q8N5Q1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM71E2Q8N5Q1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM71E2Q8N5Q1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM71E2Q8N5Q1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM71E2Q8N5Q1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM71E2Q8N5Q1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM71E2Q8N5Q1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM71E2Q8N5Q1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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FAM71E2Q8N5Q1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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FAM71E2Q8N5Q1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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FAM71E2Q8N5Q1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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FAM71E2Q8N5Q1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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FAM71E2Q8N5Q1 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms