Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GPC2Q8N158 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GPC2Q8N158 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GPC2Q8N158 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GPC2Q8N158 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GPC2Q8N158 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPC2Q8N158 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPC2Q8N158 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPC2Q8N158 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPC2Q8N158 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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