Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms