Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z35

PREX2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX2Q70Z35 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms