Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY09

CEACAM20, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 20, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM20Q6UY09 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CEACAM20Q6UY09 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms