Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 PHIP-201ENST00000275034 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.089e-7■■■■■ 32.8
PRPF8Q6P2Q9 ITGA6-208ENST00000469534 581 ntTSL 24.24□□□□□ -1.736e-7■■■■■ 32.8
PRPF8Q6P2Q9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.144e-7■■■■■ 32.8
PRPF8Q6P2Q9 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.394e-7■■■■■ 32.8
PRPF8Q6P2Q9 AGPS-204ENST00000637633 2143 ntTSL 53.28□□□□□ -1.884e-7■■■■■ 32.8
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PRPF8Q6P2Q9 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.483e-9■■■■■ 32.8
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PRPF8Q6P2Q9 RNF5-204ENST00000487940 357 ntTSL 213.56□□□□□ -0.249e-9■■■■■ 32.8
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PRPF8Q6P2Q9 SCO1-201ENST00000255390 9612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.814e-9■■■■■ 32.8
PRPF8Q6P2Q9 RIC8A-212ENST00000530149 3417 nt8.07□□□□□ -1.122e-8■■■■■ 32.8
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PRPF8Q6P2Q9 PDHX-202ENST00000430469 952 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.823e-6■■■■■ 32.7
PRPF8Q6P2Q9 UNC119B-202ENST00000539658 485 ntTSL 513.27□□□□□ -0.282e-7■■■■■ 32.7
PRPF8Q6P2Q9 CDC25A-203ENST00000437972 730 ntTSL 325.27■■□□□ 1.643e-10■■■■■ 32.7
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PRPF8Q6P2Q9 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.023e-8■■■■■ 32.7
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PRPF8Q6P2Q9 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.23e-8■■■■■ 32.7
PRPF8Q6P2Q9 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.384e-11■■■■■ 32.7
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PRPF8Q6P2Q9 MTRR-201ENST00000264668 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.343e-8■■■■■ 32.7
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PRPF8Q6P2Q9 KALRN-203ENST00000354186 10586 ntAPPRIS ALT2 TSL 58.64□□□□□ -1.031e-6■■■■■ 32.7
PRPF8Q6P2Q9 KALRN-202ENST00000291478 10888 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.271e-6■■■■■ 32.7
PRPF8Q6P2Q9 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.441e-6■■■■■ 32.7
PRPF8Q6P2Q9 UBASH3B-201ENST00000284273 6912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.863e-6■■■■■ 32.7
PRPF8Q6P2Q9 PDCD6IP-206ENST00000457054 5962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.982e-7■■■■■ 32.7
PRPF8Q6P2Q9 PDCD6IP-201ENST00000307296 6161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.232e-7■■■■■ 32.7
PRPF8Q6P2Q9 KIDINS220-209ENST00000489024 4084 ntTSL 57.2□□□□□ -1.263e-9■■■■■ 32.7
PRPF8Q6P2Q9 KIDINS220-201ENST00000256707 7361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.473e-9■■■■■ 32.7
PRPF8Q6P2Q9 KIDINS220-210ENST00000496383 3220 ntTSL 55.76□□□□□ -1.493e-9■■■■■ 32.7
PRPF8Q6P2Q9 KIDINS220-206ENST00000473731 7248 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.53e-9■■■■■ 32.7
PRPF8Q6P2Q9 KIDINS220-212ENST00000569008 8735 ntTSL 54.85□□□□□ -1.633e-9■■■■■ 32.7
PRPF8Q6P2Q9 KIDINS220-208ENST00000488729 5988 ntTSL 1 (best)4.44□□□□□ -1.73e-9■■■■■ 32.7
PRPF8Q6P2Q9 ADSL-223ENST00000638161 668 ntTSL 52.36□□□□□ -2.031e-8■■■■■ 32.7
PRPF8Q6P2Q9 INO80-206ENST00000559995 566 ntTSL 51.78□□□□□ -2.122e-7■■■■■ 32.7
PRPF8Q6P2Q9 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.031e-7■■■■■ 32.7
PRPF8Q6P2Q9 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.621e-7■■■■■ 32.7
PRPF8Q6P2Q9 NDE1-201ENST00000396354 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.21e-6■■■■■ 32.7
PRPF8Q6P2Q9 NDE1-202ENST00000396355 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.261e-6■■■■■ 32.7
PRPF8Q6P2Q9 KAT7-217ENST00000513980 1387 ntTSL 24.43□□□□□ -1.73e-7■■■■■ 32.7
PRPF8Q6P2Q9 KAT7-216ENST00000513171 912 ntTSL 54.17□□□□□ -1.743e-7■■■■■ 32.7
PRPF8Q6P2Q9 KAT7-214ENST00000512616 1289 ntTSL 23.39□□□□□ -1.873e-7■■■■■ 32.7
PRPF8Q6P2Q9 KAT7-218ENST00000514540 648 ntTSL 52.53□□□□□ -23e-7■■■■■ 32.7
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