Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms