Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms