Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK2

SOHLH1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOHLH1Q5JUK2 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SOHLH1Q5JUK2 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SOHLH1Q5JUK2 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SOHLH1Q5JUK2 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SOHLH1Q5JUK2 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SOHLH1Q5JUK2 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SOHLH1Q5JUK2 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SOHLH1Q5JUK2 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SOHLH1Q5JUK2 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SOHLH1Q5JUK2 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SOHLH1Q5JUK2 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SOHLH1Q5JUK2 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SOHLH1Q5JUK2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SOHLH1Q5JUK2 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SOHLH1Q5JUK2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SOHLH1Q5JUK2 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SOHLH1Q5JUK2 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SOHLH1Q5JUK2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SOHLH1Q5JUK2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SOHLH1Q5JUK2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SOHLH1Q5JUK2 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SOHLH1Q5JUK2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SOHLH1Q5JUK2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SOHLH1Q5JUK2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SOHLH1Q5JUK2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SOHLH1Q5JUK2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SOHLH1Q5JUK2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SOHLH1Q5JUK2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SOHLH1Q5JUK2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SOHLH1Q5JUK2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SOHLH1Q5JUK2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SOHLH1Q5JUK2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SOHLH1Q5JUK2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SOHLH1Q5JUK2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SOHLH1Q5JUK2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms