Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms