Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms