Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms