Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EDRF1Q3B7T1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EDRF1Q3B7T1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EDRF1Q3B7T1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EDRF1Q3B7T1 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EDRF1Q3B7T1 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EDRF1Q3B7T1 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EDRF1Q3B7T1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EDRF1Q3B7T1 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EDRF1Q3B7T1 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDRF1Q3B7T1 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDRF1Q3B7T1 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EDRF1Q3B7T1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDRF1Q3B7T1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDRF1Q3B7T1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EDRF1Q3B7T1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDRF1Q3B7T1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDRF1Q3B7T1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDRF1Q3B7T1 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDRF1Q3B7T1 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDRF1Q3B7T1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDRF1Q3B7T1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDRF1Q3B7T1 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDRF1Q3B7T1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EDRF1Q3B7T1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDRF1Q3B7T1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDRF1Q3B7T1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDRF1Q3B7T1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EDRF1Q3B7T1 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDRF1Q3B7T1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDRF1Q3B7T1 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDRF1Q3B7T1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDRF1Q3B7T1 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDRF1Q3B7T1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDRF1Q3B7T1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDRF1Q3B7T1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDRF1Q3B7T1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms