Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HFEQ30201 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HFEQ30201 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HFEQ30201 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HFEQ30201 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HFEQ30201 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HFEQ30201 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HFEQ30201 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HFEQ30201 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HFEQ30201 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HFEQ30201 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HFEQ30201 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HFEQ30201 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HFEQ30201 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HFEQ30201 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HFEQ30201 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HFEQ30201 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HFEQ30201 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HFEQ30201 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HFEQ30201 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HFEQ30201 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HFEQ30201 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HFEQ30201 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HFEQ30201 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HFEQ30201 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HFEQ30201 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HFEQ30201 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HFEQ30201 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HFEQ30201 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HFEQ30201 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HFEQ30201 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HFEQ30201 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HFEQ30201 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HFEQ30201 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HFEQ30201 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HFEQ30201 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HFEQ30201 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HFEQ30201 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HFEQ30201 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HFEQ30201 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HFEQ30201 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HFEQ30201 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HFEQ30201 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HFEQ30201 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HFEQ30201 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HFEQ30201 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HFEQ30201 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HFEQ30201 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HFEQ30201 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HFEQ30201 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HFEQ30201 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HFEQ30201 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HFEQ30201 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HFEQ30201 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HFEQ30201 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HFEQ30201 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HFEQ30201 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HFEQ30201 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HFEQ30201 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HFEQ30201 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HFEQ30201 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HFEQ30201 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HFEQ30201 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HFEQ30201 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HFEQ30201 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HFEQ30201 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HFEQ30201 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HFEQ30201 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HFEQ30201 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HFEQ30201 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HFEQ30201 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HFEQ30201 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HFEQ30201 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HFEQ30201 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HFEQ30201 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HFEQ30201 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HFEQ30201 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HFEQ30201 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HFEQ30201 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HFEQ30201 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HFEQ30201 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HFEQ30201 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HFEQ30201 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HFEQ30201 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HFEQ30201 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HFEQ30201 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HFEQ30201 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HFEQ30201 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HFEQ30201 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HFEQ30201 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HFEQ30201 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HFEQ30201 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HFEQ30201 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HFEQ30201 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HFEQ30201 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HFEQ30201 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HFEQ30201 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HFEQ30201 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HFEQ30201 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HFEQ30201 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms