Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ISXQ2M1V0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms