Protein–RNA interactions for Protein: Q16778

HIST2H2BE, Histone H2B type 2-E, humanhuman

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2BEQ16778 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST2H2BEQ16778 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST2H2BEQ16778 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST2H2BEQ16778 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST2H2BEQ16778 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST2H2BEQ16778 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST2H2BEQ16778 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST2H2BEQ16778 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST2H2BEQ16778 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST2H2BEQ16778 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST2H2BEQ16778 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST2H2BEQ16778 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST2H2BEQ16778 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST2H2BEQ16778 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST2H2BEQ16778 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST2H2BEQ16778 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST2H2BEQ16778 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST2H2BEQ16778 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST2H2BEQ16778 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST2H2BEQ16778 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST2H2BEQ16778 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST2H2BEQ16778 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST2H2BEQ16778 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST2H2BEQ16778 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST2H2BEQ16778 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
HIST2H2BEQ16778 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
HIST2H2BEQ16778 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
HIST2H2BEQ16778 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
HIST2H2BEQ16778 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HIST2H2BEQ16778 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HIST2H2BEQ16778 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HIST2H2BEQ16778 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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HIST2H2BEQ16778 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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HIST2H2BEQ16778 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HIST2H2BEQ16778 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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HIST2H2BEQ16778 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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HIST2H2BEQ16778 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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HIST2H2BEQ16778 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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HIST2H2BEQ16778 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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HIST2H2BEQ16778 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HIST2H2BEQ16778 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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HIST2H2BEQ16778 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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HIST2H2BEQ16778 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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HIST2H2BEQ16778 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST2H2BEQ16778 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST2H2BEQ16778 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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HIST2H2BEQ16778 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST2H2BEQ16778 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST2H2BEQ16778 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST2H2BEQ16778 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST2H2BEQ16778 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST2H2BEQ16778 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST2H2BEQ16778 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST2H2BEQ16778 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST2H2BEQ16778 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST2H2BEQ16778 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST2H2BEQ16778 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST2H2BEQ16778 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST2H2BEQ16778 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST2H2BEQ16778 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST2H2BEQ16778 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST2H2BEQ16778 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST2H2BEQ16778 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST2H2BEQ16778 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST2H2BEQ16778 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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