Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NTRK2Q16620 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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