Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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