Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF13Q15543 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms