Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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