Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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HERPUD1Q15011 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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HERPUD1Q15011 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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HERPUD1Q15011 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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