Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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