Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RFTN1Q14699 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
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