Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
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BECN1Q14457 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
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BECN1Q14457 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
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BECN1Q14457 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
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