Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTTNQ14247 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CTTNQ14247 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CTTNQ14247 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CTTNQ14247 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CTTNQ14247 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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