Protein–RNA interactions for Protein: Q14114

LRP8, Low-density lipoprotein receptor-related protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP8Q14114 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms